FDA phê duyệt xét nghiệm máu đầu tiên tìm yếu tố di truyền làm tăng nguy cơ ung thư ở hàng chục loại

 (insideprecisionmedicine.com)
1 điểm bởi GN⁺ 2023-10-04 | 1 bình luận | Chia sẻ qua WhatsApp
  • FDA đã cấp phép Invitae Common Hereditary Cancers Panel, mở ra khả năng đánh giá các biến thể DNA ở 47 gen liên quan đến nguy cơ ung thư gia tăng chỉ từ mẫu máu
  • Quyết định cấp phép tiếp thị de novo lần này tạo ra một phân loại quản lý mới, cho phép các thiết bị cùng loại về sau có thể đi theo quy trình tiền lưu hành FDA 510(k)
  • FDA đã thiết lập các biện pháp kiểm soát đặc biệt bao gồm ghi nhãn và thử nghiệm hiệu năng, đồng thời áp các yêu cầu cao về tỷ lệ phù hợp dương tính và âm tính đối với độ chính xác báo cáo các biến thể chính
  • Xét nghiệm kê đơn được lấy máu tại điểm chăm sóc và phân tích trong phòng thí nghiệm; việc diễn giải biến thể sử dụng kết hợp tài liệu khoa học, cơ sở dữ liệu công khai, chương trình dự đoán và cơ sở dữ liệu tuyển chọn nội bộ của Invitae
  • Dương tính giả, âm tính giả và việc hiểu sai kết quả là các rủi ro chính; đặc biệt, âm tính giả có thể khiến bệnh nhân bỏ lỡ việc theo dõi hoặc quản lý lâm sàng cần thiết

FDA cấp phép và phạm vi xét nghiệm

  • FDA đã phê duyệt xét nghiệm máu đầu tiên có thể giúp xác định hàng trăm biến thể di truyền có khả năng liên quan đến ung thư
  • Invitae Common Hereditary Cancers Panel tìm các biến thể DNA trong 47 gen liên quan đến nguy cơ tăng mắc một số loại ung thư từ mẫu máu
  • Một xét nghiệm duy nhất có thể đánh giá nhiều gen và sử dụng giải trình tự thế hệ mới (NGS)
  • Jeff Shuren của FDA Center for Devices and Radiological Health cho rằng độ nhạy và tốc độ của NGS giúp mang lại hiểu biết sâu hơn về các biến thể di truyền

Phân loại quản lý mới và yêu cầu hiệu năng

  • FDA đã cấp cho xét nghiệm này de novo marketing authorization, qua đó tạo ra một phân loại quản lý mới
  • Các thiết bị cùng loại về sau có thể nhận phê duyệt tiếp thị thông qua quy trình tiền lưu hành 510(k) của FDA
  • Cùng với phê duyệt De Novo này, FDA đã thiết lập các biện pháp kiểm soát đặc biệt để xác định các yêu cầu liên quan đến ghi nhãn và thử nghiệm hiệu năng
    • Độ chính xác báo cáo đối với thay thế, chèn/xóa và biến thể số bản sao phải đạt tỷ lệ phù hợp dương tính ≥99,0% so với phương pháp trực giao đã được xác thực
    • Tỷ lệ phù hợp âm tính cho các hạng mục tương tự phải đạt ≥99,9%

Nhu cầu xét nghiệm ung thư di truyền và khoảng cách trong sử dụng

  • Theo CDC, có hơn 100 loại ung thư và đây là nguyên nhân gây tử vong đứng thứ hai tại Mỹ sau bệnh tim
  • Số lượng biến thể ung thư di truyền đã được xác định và các xét nghiệm liên quan vẫn tiếp tục tăng đều
  • Tuy vậy, mức độ sử dụng thực tế các xét nghiệm cho những biến thể này không tăng đáng kể

Quy trình chăm sóc và phản hồi của bệnh nhân

  • Nhóm nghiên cứu tại University of Vermont Medical Center đã hợp tác với Invitae để xét nghiệm sớm cho bệnh nhân ung thư tiến triển và cung cấp tư vấn di truyền khi phát hiện biến thể di truyền gây bệnh
  • Trong công bố tại ASCO, mức độ hài lòng với quy trình xét nghiệm được đơn giản hóa đã được khảo sát ở bệnh nhân và nhà cung cấp dịch vụ y tế
    • Hơn 94% bệnh nhân đánh giá tích cực việc được xét nghiệm ngay trong các cuộc hẹn khám thông thường
    • 82% người tham gia cho biết họ tự tin rằng mình hiểu kết quả xét nghiệm

Cách thức xét nghiệm kê đơn và diễn giải biến thể

  • Xét nghiệm kê đơn của Invitae được thực hiện bằng cách lấy mẫu tại điểm chăm sóc như phòng khám bác sĩ rồi gửi đến phòng thí nghiệm
  • Việc diễn giải lâm sàng các biến thể dựa trên các nguồn bằng chứng sau
    • Tài liệu khoa học đã công bố
    • Cơ sở dữ liệu công khai
    • Chương trình dự đoán
    • Cơ sở dữ liệu biến thể được tuyển chọn nội bộ của Invitae
  • Tiêu chí diễn giải biến thể dựa trên các chuẩn do tổ chức chuyên môn hoặc hội đồng chứng nhận đặt ra

Các gen chính và bệnh liên quan

  • Các gen có ý nghĩa lâm sàng được xác định trong xét nghiệm bao gồm BRCA1·BRCA2, liên quan đến hội chứng ung thư vú và buồng trứng di truyền
  • Các gen liên quan đến hội chứng Lynch bao gồm MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM
  • CDH1 chủ yếu liên quan đến ung thư dạ dày lan tỏa di truyền và ung thư vú thể tiểu thùy
  • STK11 liên quan đến Peutz-Jeghers Syndrome

Rủi ro xét nghiệm và lưu ý lâm sàng

  • Các rủi ro chính liên quan đến xét nghiệm này là dương tính giả, âm tính giả và hiểu sai kết quả
  • Kết quả âm tính giả có thể mang lại cảm giác an tâm sai lầm cho bệnh nhân
  • Bệnh nhân nhận kết quả âm tính giả có thể không được theo dõi hoặc quản lý lâm sàng phù hợp

Bài viết liên quan

1 bình luận

 
GN⁺ 2023-10-04
Ý kiến trên Hacker News

  • Tin rất hay. Tôi đã làm xét nghiệm Invitae, khởi nguồn là bài viết này: https://jakeseliger.com/2023/07/22/i-am-dying-of-squamous-ce...
    Theo tôi hiểu, việc được FDA phê duyệt có nghĩa là có thể được bảo hiểm chi trả
    Theo những gì tôi nghe từ các bác sĩ ung thư nội khoa, xét nghiệm máu hiện gần như là vùng vô luật trong lĩnh vực lập hồ sơ ung thư. Việc các xét nghiệm máu như CARIS https://www.carislifesciences.com/products-and-services/mole... hay Guardant360 https://guardanthealth.com/products/tests-for-patients-with-... được phê duyệt có vẻ quan trọng từ góc độ bảo hiểm

    • FDA phê duyệt chỉ là bước đầu tiên để bác sĩ lâm sàng thực sự sử dụng và công ty bảo hiểm hoàn trả chi phí
      Để yêu cầu bác sĩ kê đơn và được bảo hiểm hoàn trả, có khả năng vẫn mất khoảng 2 năm, thậm chí lâu hơn
      Tuy nhiên, giờ đây về mặt pháp lý họ có thể quảng bá sản phẩm, và về lý thuyết bạn có thể tự trả tiền để làm xét nghiệm
    • FDA cấp phép và bảo hiểm chi trả là hai chuyện riêng biệt. Tôi biết một nhà sản xuất nhỏ đã bán sản phẩm được cấp phép hơn 3 năm, nhưng không có công ty bảo hiểm nào chi trả cho sản phẩm đó
      Việc được bảo hiểm chi trả về cơ bản là trò chơi chờ đợi giữa nhà sản xuất và công ty bảo hiểm. Nếu có đủ vốn để trụ lại và xây dựng quan hệ với các lãnh đạo, bạn có thể được chi trả; nếu không thì không dễ
    • Hỏi thế này có thể hơi bất lịch sự, nhưng tôi tò mò tình trạng hiện nay ra sao. Tình hình đã tốt hơn chưa

  • Nói cho rõ, xét nghiệm này kiểm tra 47 gen liên quan đến nguy cơ ung thư tăng cao. Khác với các xét nghiệm máu như Galleri, đây không phải xét nghiệm cho biết hiện tại bạn có bị ung thư hay không
    0: https://www.galleri.com/

    • Đã có khá nhiều xét nghiệm máu có thể cho biết tiềm năng bạn có bị ung thư hay không. Một ví dụ khác là đây: https://www.personalgenome.com/products/elio-plasma-resolve
      Điểm chung là tất cả đều là xét nghiệm CLIA chứ không phải đã được FDA phê duyệt
      Xét nghiệm Invitae trong bài gốc đã được FDA phê duyệt, và đó tuyệt đối không phải thành tựu nhỏ. Đây là một quy trình không dễ, và cũng củng cố rất nhiều cho độ tin cậy của công nghệ
      Nếu Grail có thể được FDA phê duyệt cho xét nghiệm của mình thì họ đã làm rồi
    • Tôi không biết trong số đó cái nào thực sự có thể dẫn đến hành động cụ thể. Tôi tò mò liệu có khuyến nghị cụ thể nào ngoài “ăn uống lành mạnh, tập thể dục, đừng hút thuốc” hay không
      Có vẻ cũng có thể chỉ gây lo lắng mà thôi

  • Điều tôi lo nhất về các xét nghiệm kiểu này là trong tương lai, việc biết hồ sơ rủi ro của bản thân sẽ có ý nghĩa gì đối với khả năng mua/duy trì bảo hiểm y tế hoặc mức phí bảo hiểm. Tôi sống ở Hà Lan nên có lẽ không phải vấn đề lớn, nhưng ở Mỹ có thể khác, và tương lai thì không biết được
    Vì vậy tôi ít muốn làm những xét nghiệm như vậy hơn, hoặc hoàn toàn không muốn làm

    • Ở Mỹ có Genetic Information Nondiscrimination Act ban hành năm 2008, cấm phân biệt đối xử trong bảo hiểm dựa trên thông tin di truyền. Khi xét nghiệm máu thường quy, chính xác hơn là xét nghiệm di truyền, đưa y tế dự phòng lên bước tiếp theo, tôi nghĩ đây sẽ trở thành một đạo luật nền tảng quan trọng trong 50 năm tới
      https://www.genome.gov/about-genomics/policy-issues/Genetic-...
    • Ở Mỹ lẽ ra đây không nên là vấn đề. ACA yêu cầu các công ty bảo hiểm phải chi trả cả cho người có bệnh nền/tình trạng có sẵn
      GINA mà bình luận cùng cấp nhắc tới cũng liên quan ở đây, nhưng tôi không nhớ rõ tên
    • Tôi tự hỏi liệu thông tin như vậy có thể cản trở việc được tuyển dụng hay không. Nếu có hai ứng viên với các điều kiện khác như nhau, có vẻ một số công ty có thể muốn chọn người không có nguy cơ ung thư lớn
    • Ở Mỹ, GINA lẽ ra bảo vệ bạn đối với bảo hiểm y tế, nhưng không nhất thiết mở rộng sang các loại bảo hiểm khác
    • Nếu nói về cách dùng kiểu khoa học viễn tưởng, có trường hợp một tác nhân tiên lượng, chẩn đoán và học chủ động lấy thông tin từ hồ sơ bệnh án điện tử rồi dùng nó làm xác suất tiên nghiệm
      Ở mức công nghệ thấp hơn, nếu có biến thể liên quan đến khối u có tác động lớn, bạn và bác sĩ sẽ cảnh giác hơn trong việc theo dõi hoặc xét nghiệm một số loại ung thư nhất định
      Cần nhớ rằng ung thư càng được phát hiện sớm thì tiên lượng càng cải thiện mạnh

  • Invitae đang làm việc rất tốt trong việc thương mại hóa xét nghiệm chẩn đoán di truyền chất lượng cao và cung cấp trực tiếp cho người tiêu dùng với mức giá hợp lý. Tôi đã dùng cho sàng lọc trước sinh; họ cung cấp xét nghiệm DNA tự do tuần hoàn với giá hợp lý, loại thường chỉ được bảo hiểm chi trả trong thai kỳ ở tuổi mẹ cao
    Tôi mong các bên bảo hiểm chi trả cho những xét nghiệm này để Invitae được đền đáp xứng đáng hơn cho việc họ làm, nhưng hệ thống y tế Mỹ thật sự kỳ lạ
    Một trong những vấn đề của các xét nghiệm di truyền như thế này, đặc biệt là các lĩnh vực như dược di truyền học, là các bác sĩ vẫn chưa tích hợp chúng vào khám chữa bệnh hay quy trình làm việc. Vì vậy, ngay cả khi xét nghiệm trả về thông tin có thể hành động, họ đôi khi vẫn không biết thực sự phải làm gì

    • Tôi tò mò xét nghiệm di truyền trước sinh có trường hợp sử dụng nào ngoài ưu sinh học không

  • Tôi từng làm xét nghiệm Invitae liên quan đến IVF. Thành thật mà nói, nếu điều này là khả thi, thì việc không kiểm tra xem bản thân và bạn đời có bất tương hợp di truyền nghiêm trọng đến mức phải đi đường vòng bằng IVF hay không gần như có vẻ là phi đạo đức

  • Nói rằng phải chơi với những lá bài mình được chia là đúng
    Nhưng biết xác suất của bản thân là điều tốt
    Tốt hơn nữa là khi chúng ta có thể chữa được ung thư và rút những lá bài mới

  • Liên kết trực tiếp đến thông báo của FDA:
    https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/fda-gran...

  • Đây là một việc tuyệt vời, nhưng chẳng phải các gen kiểu này cũng được nhận diện trong những xét nghiệm DNA giá rẻ như 23andMe sao? Theo tôi biết thì chắc chắn họ có xét nghiệm các biến thể BRCA1 và BRCA2
    Hay là xét nghiệm này bao gồm nhiều biến thể hơn rất nhiều?

    • 23andMe kiểm tra khoảng 1 triệu vị trí trên toàn bộ bộ gen và dùng cách đối chiếu tương quan với các biến thể gây bệnh đã biết. Ngược lại, xét nghiệm của Invitae thực sự giải trình tự các vùng mã hóa của những gen liên quan và một phần vùng lân cận, nên có thể phát hiện các đột biến hiếm[0]
      Ngoài ra, Invitae dành rất nhiều công sức để xác định một biến thể cụ thể — những biến thể sẽ tồn tại rất nhiều ở bất kỳ ai — là lành tính hay gây bệnh
      Invitae từng lập luận rằng cách tiếp cận kiểu 23andMe sẽ bỏ sót nhiều biến thể quan trọng, đặc biệt ở một số nhóm dân cư ít được đại diện [1]
      Miễn trừ trách nhiệm: tôi là cựu nhân viên Invitae và vẫn đang nắm giữ số cổ phiếu từng khá lớn. Mọi quan điểm đều là ý kiến cá nhân.
      [0] Nghĩa là hiếm ở quy mô dân số. Xấp xỉ tốt là mỗi người chỉ có 0, 1 hoặc 2 bản sao của một đa hình cụ thể
      [1] https://www.biospace.com/article/invitae-challenges-accuracy...
    • Có khác biệt lớn giữa những gì 23andMe đưa vào công nghệ và báo cáo của họ với một giải pháp xét nghiệm y tế thực sự có thể vận hành. Tuy vậy, 23andMe cũng quảng bá rằng kết quả của họ có liên quan về mặt y khoa: https://www.23andme.com/brca/
      Trong một thời gian, chỉ Myriad mới có thể xét nghiệm BRCA1/2, vì họ có bằng sáng chế đối với chính trình tự gen. Vụ này đã lên tới Tòa án Tối cao, và tòa phán quyết rằng không thể cấp bằng sáng chế cho trình tự gen người
    • Cách tiếp cận khác nhau. 23andMe cũng có đăng một phần giải thích ngắn về điều này: https://customercare.23andme.com/hc/en-us/articles/202904600...

  • Invitae đã làm tốt trong việc mở rộng xét nghiệm di truyền và tăng khả năng tiếp cận, nhưng họ đã chọn một chiến lược tăng trưởng cao đầy rủi ro và phải trả giá khi môi trường kinh tế thay đổi
    Tôi hy vọng những nỗ lực đó sẽ không biến mất, ngay cả nếu công ty về dài hạn không thể tồn tại dưới hình thức hiện tại

  • Xét nghiệm Galleri của Grail là xét nghiệm máu có thể phát hiện hơn 40 loại ung thư, một số loại còn được phát hiện ở giai đoạn sớm như giai đoạn 1
    Chi phí khoảng 1.000 USD cho mỗi lần xét nghiệm