AlphaFold - lời giải cho bài toán gấp cuộn protein

• Mô hình mạng nơ-ron do DeepMind phát triển để giải quyết bài toán gấp cuộn protein

Bài toán gấp cuộn protein

• Protein là cấu trúc phức tạp được tạo thành khi các axit amin liên kết với nhau thành chuỗi rồi gấp lại trong không gian ba chiều

• Tùy theo các axit amin cấu thành protein và cấu trúc đã gấp cuộn, chúng đảm nhiệm nhiều chức năng khác nhau

• Tuy nhiên, việc dự đoán cấu trúc của protein chỉ từ trình tự sắp xếp axit amin là rất khó

AlphaFold

• Được huấn luyện trên khoảng 170.000 dữ liệu cấu trúc protein từ Protein Data Bank cùng dữ liệu của các protein khác chưa biết cấu trúc

• Huấn luyện trong vài tuần bằng khoảng 128 lõi TPUv3

CASP (Critical Assessment of protein Structure Prediction)

• Cuộc thi dự đoán cấu trúc protein thế giới được tổ chức hai năm một lần, lần đầu diễn ra vào năm 1994

• Dự đoán cấu trúc của các protein mà cấu trúc vẫn chưa được biết đến

• Phiên bản đầu tiên của AlphaFold đã tham gia CASP13 diễn ra vào năm 2018

• Tại CASP14 diễn ra vào năm 2020, AlphaFold đứng hạng nhất với điểm GDT trung bình 92,4

• Mức sai số này tương đương độ rộng của khoảng 1 nguyên tử

Hiệu quả kỳ vọng và triển vọng

• Trong năm nay, AlphaFold đã dự đoán các protein của virus corona như ORF3a, ORF8

• Trong tương lai, hệ thống này được kỳ vọng sẽ đóng góp vào việc giải quyết nhiều vấn đề sinh học và phát triển thuốc mới

[ffdd270]

Chắc phải chăm lo sức khỏe cho tốt thôi. Cho đến khi giấc mơ kéo dài tuổi thọ thành hiện thực... Có quá nhiều điều mình muốn làm trong kiếp này ;_;

[xguru]

Tôi có thấy một bài viết nói về việc dùng protein để đảo ngược lão hóa tế bào.

Có lẽ AI sẽ làm nên chuyện lớn trong việc biến giấc mơ kéo dài tuổi thọ thành hiện thực.

Đã xuất hiện công nghệ 'đảo ngược lão hóa tế bào' giúp tế bào da già trở nên trẻ lại

http://m.dongascience.donga.com/news.php?idx=41855

Là một chiến lược để đảo ngược lão hóa tế bào, công nghệ 'tái lập trình ngược' đang được nghiên cứu rộng rãi nhất. Tái lập trình ngược là công nghệ đưa thêm 4 loại protein gọi là 'yếu tố phiên mã Yamanaka' vào những tế bào đã phát triển thành mô cơ thể cụ thể như tế bào da, để đưa chúng trở về trạng thái trẻ trước khi biệt hóa thành tế bào chuyên biệt.