1 điểm bởi GN⁺ 2024-12-03 | 1 bình luận | Chia sẻ qua WhatsApp
  • Manh mối di truyền để giải thích bộ lông màu cam và hoa văn tam thể ở mèo đã chưa được giải đáp trong hơn 60 năm, và hai nhóm nghiên cứu độc lập đã đi đến cùng một đột biến
  • Ứng viên cốt lõi là Arhgap36 trên nhiễm sắc thể X; tế bào hắc tố của mèo màu cam tạo ra RNA của gene này nhiều gấp 13 lần so với mèo không màu cam
  • Đột biến không nằm ở trình tự mã hóa protein mà là sự mất đoạn ở vùng DNA điều hòa lân cận; trong 188 bộ gene mèo, tất cả mèo màu cam, tam thể và đồi mồi đều có cùng mất đoạn này
  • Nhóm nghiên cứu Kyushu University cũng xác nhận cùng mất đoạn ở 24 con mèo hoang và mèo nuôi tại Nhật Bản cùng 258 bộ gene trên toàn thế giới; ở các vùng da màu cam của mèo tam thể, lượng Arhgap36 RNA cũng cao hơn
  • Hai nghiên cứu vẫn là preprint chưa qua bình duyệt, nhưng việc Arhgap36 tăng lên cho thấy một con đường mới, tách biệt với MC1r, chuyển tế bào hắc tố sang sản xuất sắc tố đỏ sáng

Di truyền học màu lông chưa được giải trong hơn 60 năm

  • Từ lâu người ta đã biết mèo màu cam phần lớn là đực, còn mèo tam thể (calico) và mèo đồi mồi (tortoiseshell) hầu như đều là cái
  • Việc con của mèo đen và mèo màu cam, nếu có nhiều màu, gần như luôn là mèo cái là manh mối cho thấy biến thể gene tạo lông màu cam hoặc đen nằm trên nhiễm sắc thể X
  • Mèo đực chỉ thừa hưởng một nhiễm sắc thể X từ một trong hai bố mẹ, nên thường có một màu
    • Ví dụ, nếu Garfield là mèo đực màu cam, nó đã thừa hưởng nhiễm sắc thể X duy nhất từ mẹ, nên mẹ của nó có thể là mèo màu cam
  • Mèo cái thừa hưởng một nhiễm sắc thể X từ mỗi bên bố mẹ và trong quá trình phát triển phôi, từng tế bào trải qua bất hoạt X, tức chỉ biểu hiện một trong hai nhiễm sắc thể X
    • Tùy theo nhiễm sắc thể X nào bị bất hoạt ở từng vùng da, các mảng lông đen và cam sẽ hình thành
    • Mèo tam thể có thêm lông trắng do một cơ chế di truyền riêng làm tắt sản xuất sắc tố ở một số tế bào

Lông màu cam không được giải thích bằng con đường MC1r hiện có

  • Ở hầu hết động vật có vú, bao gồm cả con người, lông đỏ liên quan đến biến thể ở protein bề mặt tế bào MC1r
  • MC1r tham gia quyết định tế bào hắc tố tạo sắc tố sẫm màu hay sắc tố đỏ-vàng sáng
    • Các đột biến làm giảm hoạt tính MC1r khiến tế bào hắc tố duy trì trạng thái sản xuất sắc tố sáng
  • Tuy nhiên, lông màu cam ở mèo không khớp nếu chỉ dựa vào MC1r
    • Ở mèo và các loài khác, gene MC1r không nằm trên nhiễm sắc thể X
    • Hầu hết mèo màu cam không có đột biến MC1r

Mất đoạn Arhgap36 do nhóm Stanford tìm thấy

  • Nhóm của Greg Barsh tại Stanford University đã phân tích mẫu da của 4 bào thai mèo màu cam và 4 bào thai không màu cam thu được từ phòng khám triệt sản
  • Nhóm nghiên cứu đo lượng RNA do tế bào hắc tố tạo ra và các gene tương ứng, như một chỉ dấu thay thế để xem biểu hiện gene của từng tế bào da
  • Tế bào hắc tố của mèo màu cam tạo ra RNA của gene Arhgap36 nhiều gấp 13 lần so với mèo không màu cam
    • Arhgap36 nằm trên nhiễm sắc thể X, phù hợp với điều kiện vị trí của ứng viên gene lông màu cam
  • Trong DNA mã hóa protein Arhgap36 của mèo màu cam không có đột biến
    • Thay vào đó, một đoạn DNA lân cận có thể điều chỉnh mức tế bào tạo ra Arhgap36 đã bị mất
  • Khi khảo sát cơ sở dữ liệu gồm 188 bộ gene mèo, tất cả mèo màu cam, tam thể và đồi mồi đều có cùng đột biến mất đoạn này
    • Kết quả nghiên cứu được công bố trong bài báo này, một preprint trên bioRxiv

Xác nhận độc lập từ nhóm Kyushu University

  • Nhóm của Hiroyuki Sasaki tại Kyushu University cũng xác nhận cùng mất đoạn di truyền bằng các thí nghiệm tương tự
  • Cùng mất đoạn này xuất hiện ở 24 con mèo hoang và mèo nuôi tại Nhật Bản, cũng như trong 258 bộ gene mèo được thu thập trên toàn thế giới
  • Trong da mèo tam thể, các vùng màu cam có nhiều Arhgap36 RNA hơn vùng màu nâu hoặc đen
  • Nhóm của Sasaki cũng ghi nhận rằng gene Arhgap36 ở chuột, mèo và người nhận các biến đổi hóa học làm im lặng gene trên một trong hai nhiễm sắc thể X ở con cái
    • Điều này cho thấy Arhgap36 là đối tượng của bất hoạt X
  • Nghiên cứu độc lập này cũng được công bố trong bài báo này, một preprint trên bioRxiv

Con đường màu lông mới và những câu hỏi còn lại

  • Sau khi biết rằng cả hai đã tìm thấy cùng một đột biến, hai nhóm nghiên cứu quyết định công bố preprint đồng thời
  • Hai nghiên cứu vẫn là preprint chưa qua bình duyệt
  • Cả hai nhóm đều xác nhận rằng khi tăng lượng Arhgap36 trong tế bào hắc tố, một con đường phân tử khiến tế bào tạo sắc tố đỏ sáng được kích hoạt, bất kể MC1r có hoạt động hay không
  • Trước đây chưa từng biết Arhgap36 có thể ảnh hưởng đến da hoặc màu lông
    • Arhgap36 tham gia vào nhiều khía cạnh của phát triển phôi
    • Barsh cho rằng các đột biến lớn ảnh hưởng đến chức năng toàn thân có thể giết chết động vật
    • Đột biến mất đoạn lần này dường như chỉ ảnh hưởng đến chức năng Arhgap36 trong tế bào hắc tố, nên mèo mang đột biến này vẫn khỏe mạnh
  • Carolyn Brown từ University of British Columbia cho rằng mô hình bất hoạt Arhgap36 ở mèo tam thể và đồi mồi đúng như một gene trên nhiễm sắc thể X, nhưng việc đột biến mất đoạn lại làm tăng hoạt tính gene thay vì làm giảm là điều bất thường
  • Leslie Lyons từ University of Missouri đánh giá đây là gene đã được chờ đợi từ lâu, và việc phát hiện một con đường phân tử mới cho màu lông là điều ngoài dự đoán
    • Lyons muốn biết đột biến này xuất hiện lần đầu khi nào và ở đâu
    • Có bằng chứng cho thấy một số mèo Ai Cập được ướp xác có màu cam

1 bình luận

 
GN⁺ 2024-12-03
Ý kiến trên Hacker News
  • Chà, đây đúng là thứ tôi đang nghiên cứu. MC1R là một thụ thể bắt cặp protein G (GPCR), còn gen/enzym ARHGAP36 là một yếu tố hoạt hóa GTPase, chuyển các GTPase họ Rho sang trạng thái bất hoạt gắn GDP
    Tức là nó phân giải GTP, và GTP (guanosine triphosphate) đóng vai trò cung cấp năng lượng cho thụ thể
    Nếu GTP quá ít hoặc quá nhiều thì độ nhạy của thụ thể MC1 sẽ thay đổi, và theo đó màu lông cũng thay đổi. Con người cũng có cùng gen này nên nguyên lý tương tự có thể áp dụng
    Tôi đang nghiên cứu GPCR đóng vai trò gì trong tâm trạng và các bệnh mạn tính như Long COVID, ME/CFS, và nếu GTP quá ít thì toàn bộ hơn 850 thụ thể bắt cặp protein G đều bị ảnh hưởng. Trong đó có cả thụ thể serotonin, dopamine và epinephrine
    Có thể xem toàn bộ danh sách tại đây: https://www.guidetopharmacology.org/GRAC/ReceptorFamiliesFor...
    Tôi bị thiếu hụt enzym PNP nên gặp khuyết tật do GTP quá nhiều, nhưng từ sau phát hiện này về năng lượng của thụ thể thì tôi đang khá hơn. GTP quá nhiều cũng gây ra tóc bạc
    Và GLP1 cũng là GPCR
    Việc tôi đọc được bài này hôm nay gần như cảm giác không chỉ là ngẫu nhiên. Tôi đã nghĩ ý tưởng của mình là sai và thậm chí còn có ý định tự tử, nhưng giờ tôi đã có một mảnh bằng chứng có thể dùng làm căn cứ từ bài báo cho thấy nếu thụ thể serotonin không có đủ GTP, thì dù serotonin có nhiều đến đâu cũng sẽ không xảy ra hoạt hóa tế bào thông qua cAMP
    Nói thêm thì các vùng màu cam của mèo có nhiều RNA Arghap36 hơn. Arghap36 nhiều hơn thì GTP giảm, mà GTP giảm thì năng lượng cung cấp cho thụ thể MC1R giảm, kéo theo việc tạo sắc tố đen/nâu cũng giảm

    • Tôi sẵn sàng tham gia làm đối tượng nghiên cứu. Tôi là PwME thế hệ thứ 2 được chẩn đoán ME/CFS từ năm 2003, và con trai tôi cũng được chẩn đoán là thế hệ thứ 3. Không hiểu bằng cách nào mà vợ tôi cũng xuất hiện triệu chứng như thể lây truyền theo chiều ngang
      Tôi được Dr. Nancy Klimas chẩn đoán năm 2009 và đã làm xét nghiệm diện rộng ở Mayo vào năm 2010. Nếu có điều gì có thể giúp ích cho nghiên cứu thì mong hãy nghiêm túc cho tôi biết. Tôi sẽ để thông tin liên hệ trong hồ sơ của mình
  • Một tài liệu hơi liên quan: https://vgl.ucdavis.edu/species/cat
    Phòng thí nghiệm Di truyền học Mèo UC Davis đã giải mã bộ mã di truyền của mèo trong nhiều năm

    • Đọc về di truyền học màu lông mèo rất thú vị. Cảm giác như đến lúc nghĩ rằng “Được rồi, giờ thì mình hiểu hết rồi!” thì có ai đó lại mang tới và hỏi “Thế cục bông này là cái gì?”
    • Tại sao lại làm xét nghiệm gen cho hoa văn lông? Cứ nhìn con mèo là biết mà, đúng không?
      Tôi cũng có cùng thắc mắc với xét nghiệm COVID/cúm. Nhiều người xem xét nghiệm như một phần của quy trình điều trị, nhưng thực ra không phải vậy. Tuy nhiên vì có thể là người lây truyền không triệu chứng nên các xét nghiệm đó vẫn hữu ích
  • Không có chuyện “gen dành cho một đặc tính nào đó”. Chỉ vì một gen có tương quan hoàn hảo với một đặc tính cụ thể không có nghĩa là gen đó chỉ làm đúng việc ấy
    Gen đó có thể làm hàng nghìn việc, và một trong số đó tình cờ là màu lông

    • Phần cuối bài đã nói đến điều này rồi:

      Trước đây chưa ai biết Arhgap36 có thể ảnh hưởng đến da hay màu lông. Theo Barsh, gen này tham gia vào nhiều khía cạnh của sự phát triển phôi thai, và các đột biến lớn ảnh hưởng đến chức năng của nó trên toàn cơ thể có lẽ sẽ giết chết con vật. Nhưng đột biến mất đoạn này dường như chỉ ảnh hưởng đến chức năng Arhgap36 trong tế bào hắc tố, nên những con mèo mang đột biến đó không chỉ khỏe mạnh mà còn rất đáng yêu

    • Một gen có thể chẳng làm gì, có thể chỉ làm một việc, hoặc có thể làm nhiều việc. Đôi khi nó chỉ ảnh hưởng đến màu sắc, nhưng thường thì không phải vậy
      Bài viết đã nói đến chuyện này rồi, nên tôi không rõ mục đích của bình luận này là gì
    • Vậy thì có phải đúng hơn là tồn tại một “thứ gì đó” thứ cấp riêng quyết định màu lông, và nó tham chiếu đến gen tương ứng để quyết định màu? Và những “thứ gì đó” thứ cấp khác như độ dài lông cũng có thể dùng chính gen đó để quyết định sao?
    • Đúng vậy. Ví dụ ở con người, tóc đỏ có tương quan với nỗi sợ nha khoa
      https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2740987/
    • Các bài báo di truyền học thường giải quyết vấn đề nhân quả bằng cách mở đầu bằng câu “tương quan không phải là quan hệ nhân quả”, rồi phần còn lại lại viết như thể đó là quan hệ nhân quả
      Đây là lĩnh vực khó làm thí nghiệm nên cũng khó trách quá, nhưng tốt hơn là đừng tin kết quả quá mạnh tay
  • Con người chia sẻ phần lớn gen với các loài có vú khác. Gen lông của mèo có phải là cùng gen với gen lông cơ thể ở người không? Gen màu cam ở mèo có điểm nào giống với gen tóc đỏ ở người không?

    • Không, mèo hơi khác các loài có vú khác
      Ở con người và hầu hết các loài có vú khác, tóc đỏ xuất hiện do đột biến ở một protein bề mặt tế bào tên là Mc1r. Protein này quyết định liệu tế bào hắc tố sẽ tạo sắc tố tối trong da hay lông, hay tạo sắc tố sáng đỏ-vàng hơn. Nếu có đột biến làm giảm hoạt tính Mc1r, tế bào hắc tố sẽ tiếp tục tạo sắc tố sáng
      Nhưng gen mã hóa Mc1r lại không giải thích được bộ lông màu cam ở mèo. Ở mèo và các loài khác, gen này không nằm trên nhiễm sắc thể X, và phần lớn mèo màu cam cũng không có đột biến Mc1r. Nhà di truyền học Greg Barsh ở Stanford gọi đây là “một bí ẩn di truyền học và một câu đố khó”
    • Nếu đọc bài thì sẽ có giải thích cả hai cơ chế hoạt động như thế nào
  • Điều thú vị là thứ người ta tìm suốt 60 năm cuối cùng lại được hai nhóm nghiên cứu độc lập gần như đồng thời tìm ra đáp án

    • https://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_discovery
    • Nếu một việc đã trở nên đủ rẻ và đủ thực tế để một người hay một nhóm làm được, thì rất có thể hơn một nhóm cũng làm được
    • Lý do điều này xảy ra là vì thụ thể bắt cặp protein G mà MC1R thuộc về đang được nghiên cứu rất sôi nổi như một mục tiêu phát triển thuốc
      https://www.nature.com/articles/s41392-024-01803-6
    • Tiến bộ công nghệ có thể đã giúp tăng tốc nghiên cứu